Spielen Sie als Yuma Ilvern und verhindern Sie, dass das Imperium die Macht der alten Drachenbehausungen ausnutzt, einschließlich der Seele des Glänzenden Drachens, die Sie in sich tragen. Mit der Hilfe Ihrer Freunde erfüllen Sie Ihr Schicksal, retten Astoria und entfesseln die Macht, die Sie besitzen.

Im ursprünglichen Spiel, das zuvor in Japan veröffentlicht wurde, war Prinzessin Excella Imperial ein nicht-spielbarer Charakter. Im neuen Refrain-Modus von Shining Resonance Refrain können sowohl sie als auch der Dragonslayer Jinas als Teammitglieder für ein neues Erlebnis hinzugefügt werden.

• Drachen galten lange Zeit als ausgestorben, und da Yuma die Fähigkeit hat, sich in einen Glänzenden Drachen zu verwandeln, wurde er vom Imperium gefangen genommen.
• Mit der Hilfe der Drachen bittet Sonia, die Prinzessin von Astoria, Yuma um Unterstützung in ihrem Kampf, um ihr Land vor der Kontrolle des Imperiums zu retten.