Als der neue Erstklässler Taiga Kagami dem Basketballteam der Seirin High beitritt, trifft er auf Tetsuya Kuroko, einen mysteriösen Jungen, der unscheinbar bis zum Gehtnichtmehr ist. Doch Kagami erlebt den Schock seines Lebens, als er erfährt, dass der praktisch unsichtbare Kuroko einst Mitglied der "Generation der Wunder" war - dem ungeschlagenen, legendären Team - und er Kagamis Hilfe will, um jeden seiner alten Teamkollegen zu besiegen!

Mit dem Ziel, die Finalrunde zu erreichen, hat Seirin Shutoku und ihren Starspieler Midorima herausgefordert. Das Team ist dank Kagami motiviert, aber gibt es eine Garantie, dass dieses Feuer nicht schnell von dem treffsicheren Midorima gelöscht wird?! Unterdessen taucht plötzlich ein Freund aus Kurokos Mittelschulzeit vor dem Team auf und schockiert alle, indem er Einblicke in Kurokos mysteriöse Vergangenheit gibt!