Die Geschichte beginnt damit, dass Kratos den Göttern als Rächer dient und versucht, eine mysteriöse dunkle Macht zu stoppen, die die Welt bedeckt hat. Während er nach der verschwundenen Sonne sucht, reist er durch die Hölle, begegnet mythologischen Kreaturen und entdeckt, dass die Göttin Persephone plant, die Welt mit Atlas zu zerstören. Kratos muss zwischen seiner persönlichen Erlösung und seiner Pflicht als Krieger der Götter wählen.

Auf seinem Weg trifft Kratos seine verlorene Tochter Calliope und erlebt emotionale Momente, die ihn mit Schuldgefühlen und den Opfern der Vergangenheit konfrontieren. Schließlich entscheidet er sich, die Chance auf ein Wiedersehen mit ihr aufzugeben, um die Welt zu retten, und kehrt in den Dienst der Götter zurück. Chains of Olympus vertieft das Innenleben von Kratos und legt den Grundstein für die explosive Fortsetzung der Serie.