Die Handlung spielt im Jahr 2025 in einem Kampfszenario, das besonders futuristisch wirkt und viele bedeutende Veränderungen der Form des Planeten aufweist. Der Protagonist des neuen Spiels ist Dave Mason, Sohn von Alex Mason, den wir im ersten Teil der Serie kennengelernt haben, während bekannte Helden aus der Vergangenheit wie Hudson und Woods ihren Auftritt haben werden.

Der Hauptfeind Raul Menendez wird zu Beginn der Geschichte durch Ereignisse eingeführt, die in den 80er Jahren stattfinden, und später wird der Titel enthüllen, wie er es bis in die Gegenwart geschafft hat, ein mächtiger Terrorist zu werden.