6. März 2035. Motoko Aramaki ist eine hochmoderne Regierungsbeamtin und Netzwerksicherheitsexpertin im Kampf gegen den Terrorismus, die Leiterin der Forschungsabteilung des riesigen multinationalen Unternehmens Poseidon Industrial. Mit einer teilweise überlegenen Verbindung zur physischen Welt und einer Präsenz in einer virtuellen Netzwerk-Welt ist Motoko eine Synthese aus mehreren Entitäten und Identitäten, die ferngesteuerte, prothetische humanoide Ersatzteile auf der ganzen Welt einsetzt, um eine Reihe von seltsamen Umständen zu untersuchen.