Die Art und Weise, wie die Themen in Der Mensch, allzu Menschlich gruppiert und angesprochen werden, entspricht der aphoristischen Form der Wahrheitsfindung. Der erste Band umfasst, neben dem Vorwort und dem Nachwort, neun Kapitel oder Teile, in denen zunächst über die ersten und letzten Dinge und anschließend über die Geschichte der moralischen Gefühle gesprochen wird; es folgen Teile, die dem religiösen Leben, der Kunst, der Kultur, der Familie und dem Staat gewidmet sind.

Diese Artikulation scheint der traditionellen Organisation der systematischen Philosophie zu entsprechen, beginnend mit den ersten und letzten Dingen, also mit einer Behandlung grundlegender Fragen, wie sie in der klassischen Metaphysik aufgeworfen und, soweit möglich, gelöst werden. Die nachfolgenden Teile scheinen ebenfalls dem traditionellen Schema der philosophischen Disziplinen zu entsprechen, wenn man den Teil über die Geschichte der moralischen Gefühle als eine Ethik, den Teil über das religiöse Leben als eine Religionsphilosophie und die übrigen als eine Ästhetik, eine Staatsphilosophie und schließlich eine Anthropologie (Der Mensch mit sich selbst) betrachtet.

Eine genauere Untersuchung des Inhalts wird jedoch zeigen, dass wir es hier mit etwas völlig anderem als einem geschlossenen System zu tun haben, und dass Nietzsche eher die dominante 'Wahrheiten' und Denkweisen von ihren systematischen Behauptungen befreien und uns den problematischen, wenn nicht veralteten, Charakter der Prinzipien der Metaphysik, Ethik, Ästhetik usw. vor Augen führen möchte.

Es ist daher nachvollziehbar, dass Nietzsche im zweiten Band die fast parodistische Reihenfolge der philosophischen Disziplinen ablehnt und die kurzen Essays und Aphorismen, die den Teil mit dem Titel Vermischte Meinungen und Sprüche bilden, verstreut, anstatt sie zu konzentrieren; dieser Teil ist auch nicht mehr in Abschnitte unterteilt, ebenso wie der zweite, der einen kurzen Dialog zwischen dem Umherirrenden und seinem Schatten enthält.