Die Geschichte folgt Ben Tennyson und dem geheimnisvollen Omnitrix, einem Gerät wie einer Uhr, das es ihm ermöglicht, verschiedene Alien-Formen anzunehmen, von denen jede ihre eigenen besonderen Kräfte hat.

Mit Hilfe einer Alien-Maschine (Omnitrix) kann Ben sich in einen der fünf Alien-Superhelden verwandeln, von denen jeder einzigartige Kräfte hat.