Die Cross Academy wird von zwei Gruppen von Schülern besucht: der Day Class und der Night Class. In der Dämmerung, wenn die Schüler der Day Class in ihr Wohnheim zurückkehren, kreuzen sie den Weg der Night Class auf ihrem Weg zur Schule. Yuki Cross und Zero Kiryu sind die Wächter der Schule und schützen die Day Class vor dem dunklen Geheimnis der Akademie: Die Night Class besteht aus Vampiren!

Yuki Cross hat keine Erinnerung an ihre Vergangenheit vor dem Moment, als sie vor zehn Jahren vor einem Vampirangriff gerettet wurde. Sie wurde vom Direktor der Cross Academy adoptiert und arbeitet nun zusammen mit Zero daran, das Geheimnis der Akademie zu bewahren. Yuki glaubt, dass Vampire und Menschen friedlich koexistieren können, aber ihr Partner hat andere Vorstellungen...