Togusa und der Neuling Tsunagi von Abschnitt 9 wurden in den Norden geschickt, nachdem Berichte aufgetaucht waren, dass Major Kusanagis künstlicher Körper in der Stadt Towada gesehen wurde. Ähnliche Gerüchte schicken Batou und Ishikawa hunderte von Meilen südlich, um in die Reihen einer kriminellen Organisation in Okinawa einzudringen. Im Laufe beider Ermittlungen erfährt Abschnitt 9, dass Hashikami und der als "Weißer Bär" bekannte Mörder planen, Shinra Mikomoto, den kürzlich gewählten Bürgermeister von New Port City, zu ermorden. Diese Nachricht lässt die verstreuten Mitglieder von Abschnitt 9 auf die Stadt herabstürzen, wo alles vom Schicksal des Bürgermeisters abhängt.