Die Cross Academy beherbergt zwei Gruppen von Schülern: die Tagesklasse und die Nachtklasse. Im Westen, wenn die Schüler der Tagesklasse zurück zu ihren Wohnheimen gehen, kreuzen sie sich mit der Nachtklasse auf dem Weg zur Schule. Yuki Cross und Zero Kiryu sind die Wächter der Schule und schützen die Tagesklasse vor dem dunklen Geheimnis der Akademie: die Nachtklasse ist voller Vampire! Ein Krieg zwischen Vampiren hat an der Cross Academy begonnen, und selbst die Schüler der Tagesklasse werden angegriffen. Kaname enthüllt schließlich seinen geheimen Plan gegenüber Zero, und Zero muss sich im Krieg für eine Seite entscheiden. Aber um den Feind zu besiegen, muss Zero an einer abscheulichen Tat teilnehmen...