Das alte bewährte Flutter Jump, Ground Pound und Yoshi's Eierwerfen kehren zurück, zusammen mit neuen Fähigkeiten und Herausforderungen, die die Möglichkeiten des Nintendo 3DS nutzen. Sie können riesige Eier verwenden, die Mega-Eier genannt werden, um Blöcke und Röhren zu zerstören und dabei Geheimnisse wie Münzen und versteckte Schlüssel zu entdecken. Je mehr Dinge zerstört werden, desto höher steigt der Mega-Ei-Zähler, was zusätzliche Leben im Verlauf bringt!