Was ist in New York passiert, während die Turtles auf der ganzen Welt verstreut waren? Ein gefährlicher Bezirksstaatsanwalt ist an die Macht gekommen, und er hasst Mutanten.

Unterstützt von mächtigen Gönnern, die ihre eigenen Pläne für die Stadt haben, tut er alles, um Hass gegen die Mutanten zu schüren. Da die TMNT abwesend sind, muss jemand einspringen und...